9月5日には高気圧が千島方面から本州方面へ向かって張り出し、アムール川下流には低気圧が進んで、北海道には高気圧の縁辺を通って湿った空気が流れ込んだ。降水量は函館で6日に39.3㎜。室蘭は5日～6日に51.4㎜、寿都は5日～6日に73.8㎜など。
局地的な大雨により熊石（八雲町）では床下浸水100戸、圧死3名、泊村では土砂崩壊により圧死2名、江差では土砂災害により、負傷者2名の被害があった。